Восприятие "глубины" позволяет человеку видеть мир в трех измерениях, а также оценивать расстояние до объектов, которые мы созерцаем. Хотя и обычные 2D изображения за счет специальных техник (перспективы, теней, освещения, фокусировки и т.п.) могут передавать иллюзию объемной картинки.
Если говорить о традиционном веб-дизайне, то он использует двухмерную среду, тем не менее, некоторые дизайнеры не против поэкспериментировать с чем-то новым. 3D эффекты на сайте могут произвести поистине незабываемое впечатление на пользователей (wow эффект). В некоторых случаях и тематиках веб-проектов это будет весьма полезно. Данная подборка содержит некоторые дизайны сайтов, с использованием иллюзии глубины.
The Pixel

Ecoda Zoo

На сайте вообще очень много интересных эффектов - там, по сути, полноценный 3D объекты есть, а не только иллюзия глубины.
WebDesignbe.com

Использование перспективы во всей красе.
Gardener & Marks

Иллюзию 3D создают тени на разных объектах.
Dez Vila Aplina

По сути, еще одна интересная техника создания 3D. Такое часто было в компьютерных играх - называлось вид "сверх сбоку".
Imaginamos

Adobe Creative Suite 3

На сайте используется 3D иллюстрация с анимацией.
Wing Cheng

В принципе, ничего необычного - используется для всех страниц один и тот же прием, но все равно смотрится весьма гармонично и красиво. Ну, и главное - иллюзия глубины достигнута.
The Villager Restaurant

3D используется в шапке сайта дабы выделить горизонтальное меню и подчеркнуть красивый экстерьер ресторана.
Aka-Acid

Еще один вид "сверху сбору" + 3D объемные элементы.
Adlucent

Объемность достигается за счет перспективы.
Hippo App

Кроме иллюзии объема здесь также при движении курсора мышки разные объекты перемещаются и это придает еще больше иллюзии глубины. Кстати, такие вещи создаются с помощью HTML5.
Ссылки по теме